Endoscopie laat toe om onder andere de mond, keel, neus, strottenhoofd, luchtpijn, longen, slokdarm, maag, darmen en urinewegen van binnenuit de bekijken en te beoordelen. Langs het werkkanaal van de endoscoop kan bovendien een biopsie-instrument worden ingebracht, zodat bij eventuele afwijkingen gericht staaltjes kunnen genomen worden. Deze worden dan histologisch geëvalueerd in een gespecialiseerd labo en leveren vaak heel nuttige informatie.
